En 1962 se constituye el laboratorio de análisis, situado en el Complejo Oleícola de la FPCO de Montoro (Córdoba), con objeto de controlar las experiencias realizadas en la almazara experimental. Desde entonces, ha ido ampliando sus objetivos iniciales, y, en el momento actual, cuenta con medios técnicos y humanos para realizar las determinaciones analíticas propias de la aceituna, el aceite de oliva y los sub-productos de la almazara. Los objetivos que persigue el Laboratorio se pueden sintetizar en los siguientes puntos:

• Análisis relacionados con la actividad de la Almazara Experimental.
  
• Control de la calidad y pureza de los aceites de oliva vírgenes envasados por el Patrimonio en su Envasadora de Mora (Toledo).
  
• Servicio a los olivareros y productores de aceite de oliva, en todo lo relacionado con la aceituna, el aceite y subproductos.
  
• Seguimiento de las calidades de los aceites de oliva envasadas.
  
• Prueba de cata (caracteres organolépticos).